普瑞文献 | 表观遗传学在荨麻疹发病机制中的研究

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英文题目:Genome-Wide DNA Methylation Profile in Whole Blood of Patients With Chronic Spontaneous Urticaria

中文题目:慢性自发性荨麻疹患者全血DNA在全基因组中的甲基化谱

IF: 7.00

期刊:Frontiers in Immunology

合作单位:中国医科大学第一医院



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背景

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荨麻疹是一种常见的自身免疫的皮肤疾病;表观遗传学在荨麻疹的发病机制的作用尚不清楚,本研究的目的是在荨麻疹患者全血中DNA甲基化谱。CSU是一种常见的肥大细胞引起的过敏性皮肤病其特征是自发性鞭痕和血管性水肿,两者至少持续6周,CSU是多基因自发性皮肤疾病和多因素促发的发病机制,尽管之前的候选基因研究已经被报道过和CSU关联的基因变异,没有广泛接受的易感性或风险位点CSU已经确认。



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方法

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基于95个荨麻疹患者和95个正常的人的样本用850k芯片技术检测全基因组甲基化水平,筛选出差异的基因并根据GO和KEGG数据库进行功能注释。



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结果

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总共439个差异的位点 (DMPs) (p< 0.01 and |Db| ≥ 0.06),380个低甲基化和59个高甲基化位点被确定,在荨麻疹患者在439个差异位点中整体甲基化的水平明显的低于正常人的水平。439个位点被分配到1-22号染色体和X染色体上,6号染色体差异位点最多(n=51),并且注释到的基因主要和自身免疫病相关,被注释到的304个差异基因都被富集到自身免疫疾病和免疫疾病相关通路。当p < 0.01 and |Db| ≥ 0.1发现其中有41个差异的位点被注释到28个差异基因。在这28个基因中,其中HLA-DPB2, HLA-DRB1, PPP2R5C, and LTF这些基因是和自身免疫疾病相关,总lgE升高,抗甲状腺过氧化酶IgG自身抗体阳性,抗甲状腺球蛋白IgG抗体阳性,血管性水肿,UASday > 4,或复发CSU与总IgE正常的病例相比,显示表型特异性DMPs,抗甲状腺过氧化酶IgG自身抗体阴性,抗甲状腺球蛋白IgG抗体阳性,血管性水肿,UASday≤ 4,分别无复发性的CSU。


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结论

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这项研究展示了全基因组甲基化在CSU患者和正常人中的区别,也表明了表观研究在CSU疾病中的研究机制。CSU免疫通路的差异基因在GO和KEGG数据库的富集,为CSU免疫发病机制提供了有力的证据。对CSU相关DMP和DMG的研究,有助于发现CSU潜在的治疗靶点。

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