单细胞Ab-seq服务

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近年来,蛋白质作为生命活动的功能执行体,其研究价值越来越受到重视,将蛋白组学和基因组学研究结合在一起进行多维度单细胞信息解读,不仅能够更好地观察细胞之间的异质性,同时也能够更清楚地识别特定细胞及其功能。BD Abseq 与BD RhapsodyTM 高通量单细胞捕获系统结合使用的方式,能够使研究人员同时分析数千个单细胞中的 RNA 和蛋白质,完整揭示出生物学系统中基因和蛋白质的作用。

AbSeq是利用特异性抗体核酸偶联结构,将蛋白表达量转化为核酸含量,然后通过高通量测序手段检测蛋白含量。

11.jpg

 抗体核酸偶联结构图



技术流程

BD Rhapsody™融合了 WTA 和 Abseq 两种单细胞检测技术,将蛋白组和转录组的检测过程在单细胞水平很好地进行了融合。细胞经过 BD AbSeq Ab-oligos 标记后,通过 BD Rhapsody™  微孔沉降技术捕获单细胞全转录组 mRNA 和 Ab-oligo。然后,利用文库扩增试剂对同一样本产生平行的 RNA 和 BD AbSeq 测序文库。经过高通量测序后获得 RNA 和蛋白表达的数据,并使用特定分析软件 SeqGeqTM 进行数据分析。

 12.jpg

实验技术流程图


技术优势

  可对同一个样本,在一次实验中得到高通量mRNA 和 蛋白表达量数据

  蛋白的表达量数据可弥补mRNA中不能检测到的信息

  依据蛋白的表达量数据更加准确可靠的鉴定细胞亚群


应用方向

  肿瘤异质性  

  组织发育机制 

  治疗干预反应 

  生物标志物发现 


抗体列表

目前 BD 公司推出的 Abseq 抗体约有400余种(人和小鼠),可以满足大部分实验需求。部分列表如下(如需全部抗体目录,请咨询中科普瑞当地销售人员)。

Calalog No.

Product Description

Specificity

940000

Hu CD3 Ab-O AHS0033 SK7  25Tst

CD3

940001

Hu CD4 Ab-O AHS0032 SK3 25Tst

CD4

940002

Hu CD45 Ab-O AHS0040 HI30 25Tst

CD45

940003

Hu CD8 Ab-O AHS0027 RPA-T8 25Tst

CD8

940004

Hu CD19 Ab-O AHS0030 SJ25C1 25Tst

CD19

940005

Hu CD14 Ab-O AHS0037 MPHIP9 25Tst

CD14

940006

Hu CD16 Ab-O AHS0053 3G8 25Tst

CD16

940007

Hu CD56 Ab-O AHS0019 NCAM16.2 25Tst

CD56

940008

Hu CD11b Ab-O AHS0005 M1/70 25Tst

CD11b

940009

Hu CD25 Ab-O AHS0026 2A3 25Tst

CD25

940010

Hu HLA-DR Ab-O AHS0035 G46-6 25Tst

HLA-DR

940011

Hu CD45RA Ab-O AHS0009 HI100 25Tst

CD45RA

940012

Hu CD127 Ab-O AHS0028 HIL-7R-M21 25Tst

CD127

940013

Hu CD38 Ab-O AHS0022 HIT2 25Tst

CD38

940014

Hu CD197 Ab-O AHS0007 3D12 25Tst

CD197

940015

Hu CD279 Ab-O AHS0014 EH12.1 25Tst

CD279

940016

Hu CD20 Ab-O AHS0008 2H7 25Tst

CD20

940017

Hu CD28 Ab-O AHS0024 CD28.2 25Tst

CD28

940018

Hu CD27 Ab-O AHS0025 M-T271 25Tst

CD27

940019

Hu CD69 Ab-O AHS0010 FN50 25Tst

CD69

940020

Hu CD123 Ab-O AHS0020 7G3 25Tst

CD123

940021

Hu CD34 Ab-O AHS0061 581 25Tst

CD34

940022

Hu CD45RO Ab-O AHS0036 UCHL1 25Tst

CD45RO

940024

Hu CD11c Ab-O AHS0056 B-LY6 25Tst

CD11c

940025

Hu CD86 Ab-O AHS0057 2331 (FUN-1) 25Tst

CD86

940026

Hu IgD Ab-O AHS0058 IA6-2 25Tst

IgD

940027

Hu IgG Ab-O AHS0059 G18-145 25Tst

IgG

940028

Hu CD24 Ab-O AHS0042 ML5 25Tst

CD24

940029

Hu CD7 Ab-O AHS0043 M-T701 25Tst

CD7

940030

Hu CD183 Ab-O AHS0031 1C6/CXCR3 25Tst

CD183

940031

Hu CD33 Ab-O AHS0044 WM53 25Tst

CD33

940032

Hu CD90 Ab-O AHS0045 5E10 25Tst

CD90

940033

Hu CD196 (CCR6) Ab-O AHS0034 11A9 25Tst

CD196 (CCR6)

940034

Hu CD152 Ab-O AHS0017 BNI3 25Tst

CD152

940035

Hu CD274 Ab-O AHS0004 MIH1 25Tst

CD274

940036

Hu CD80 Ab-O AHS0046 L307.4 25Tst

CD80

940037

Hu CD95 Ab-O AHS0023 DX2 25Tst

CD95


结果展示

15828639376495.jpg 

单细胞水平上蛋白质与基因表达的相关性图


15828639724701.jpg

覆盖两种蛋白标记物(CD4 和 CD45RA)的t-SNE 分析表达热图


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