5mC通过TET酶家族氧化生成5-羟甲基胞嘧啶（5hmC），进一步氧化产生5fC和5caC，参与DNA去甲基化过程。5hmC相对稳定，在肿瘤组织中含量较低，与肿瘤等疾病进展相关，具有作为生物标志物的潜力。中科普瑞提供基于糖基化保护+APOBEC脱氨酶法的5hmC检测服务，支持芯片与测序双平台，精准区分5mC与5hmC，为您的研究提供单碱基分辨率的羟甲基化图谱。
TET介导的5mC氧化产物，经5hmC→5fC→5caC途径参与主动去甲基化，调控基因表达。
5hmC含量虽远低于5mC，但相对稳定，在脑组织等组织中含量较高，具有独立表观调控功能。
肿瘤组织中5hmC水平显著降低，与肿瘤发生发展密切相关，在肿瘤早筛与诊断中具有重要价值。
通过β-GT糖基化转移酶保护5hmC，再经APOBEC3A脱氨酶选择性脱氨未修饰C和5mC，最终通过测序精准区分5mC与5hmC
β-葡萄糖基转移酶（β-GT）将葡萄糖基团特异性转移到5hmC的羟甲基上，形成糖基化的5gmC，从而保护5hmC不被后续脱氨酶作用。
APOBEC3A（A3A）脱氨酶能够高效脱去未修饰胞嘧啶（C）和5-甲基胞嘧啶（5mC）的氨基，使其变为尿嘧啶（U）和胸腺嘧啶类似物。糖基化保护的5gmC不被A3A识别。
经PCR扩增后，U对应位置变为T。测序中读为C的位点即为5hmC位点。结合总甲基化样本（如WGBS或芯片）的对比分析，可精准计算5mC和5hmC的各自水平。
单碱基分辨率、高特异性区分5mC/5hmC、无需重亚硫酸盐处理、DNA损伤小、兼容芯片与测序平台。
基于EPIC甲基化芯片平台的芯片法与基于高通量测序的测序法，两种技术路线各有优势，按需选择
基于EPIC 935K甲基化芯片平台，结合5hmC糖基化保护与APOBEC脱氨技术，一次性检测935,000个CpG位点的羟甲基化状态，适合大样本队列和EWAS研究。
基于DNA羟甲基化测序技术，分为全基因组5hmC测序和靶向捕获5hmC测序。全基因组模式可发现新型5hmC标记，靶向模式聚焦特定区域，深度更高，适合验证研究。
| 比较维度 | 芯片法（935K） | 全基因组测序法 | 靶向捕获测序法 |
|---|---|---|---|
| 覆盖范围 | 935,000 CpG位点 | 全基因组 | 目标区域（可定制） |
| 推荐数据量 | 标准芯片通量 | ~15G / 样本 | 目标区域80-100× |
| 分辨率 | 单碱基 | 单碱基 | 单碱基 |
| 适用场景 | 大样本队列、EWAS | 发现新标记、机制研究 | 验证研究、临床转化 |
| 样本量适配 | 大样本（几十~上千） | 中小样本（几~几十） | 中大样本（几十~几百） |
| 成本水平 | ★★★（性价比高） | ★（较高） | ★★（中等） |
糖基化保护 + 脱氨酶法双重保障，精准区分5mC与5hmC，特异性优于传统富集方法。
芯片 + 测序双平台，满足从大样本筛库到精细机制研究的不同通量需求。
精确定位每个5hmC位点，实现基因组水平的羟甲基化图谱绘制。
支持低输入样本，最低500ng基因组DNA即可完成检测，适合珍贵样本。
功能区域深度注释，CpG岛、启动子、增强子、基因体等多维注释与富集分析。
大量5hmC研究项目经验，覆盖肿瘤、神经、发育等多领域，助力高水平论文发表。
5mC/5hmC联合分析，动态修饰关联研究，揭示DNA甲基化调控的完整图景。
根据研究需求提供定制化生信分析方案，支持多组学联合分析与深入挖掘。
标准分析 + 高级分析，从质控到功能注释再到联合分析，全面解析羟甲基组学数据
支持多种样本类型，从基因组DNA到组织、细胞、血液、FFPE均有成熟方案
推荐≥1µg，最低≥500ng
推荐≥50mg
推荐≥1×10⁶个
推荐≥2mL
≥5张（10µm）
OD260/280 = 1.7~1.9
温馨提示： 样本采集与运输请遵循相应规范，如有特殊样本类型或保存条件疑问，欢迎咨询技术支持团队
从基础分析到深度联合分析，提供多档方案满足不同研究层次需求
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