肿瘤研究
多组学解决方案

组织甲基化检测灵敏度更高，适合肿瘤组织样本直接研究甲基化特征；cfDNA甲基化是液体活检，无创、可动态监测，适合早筛、术后复发监测和疗效评估。如果是做机制研究，推荐组织样本；如果是做临床转化、早筛或动态监测，推荐cfDNA。两者也可以联合使用，先用组织发现标志物，再用cfDNA验证临床价值。

Olink基于PEA技术，灵敏度高（pg级）、样本量小（1μL）、重复性好，适合检测低丰度蛋白如细胞因子、信号分子，特别适合血浆/血清样本的biomarker筛选；质谱蛋白组覆盖范围广（理论上全蛋白组），可以发现新的蛋白标志物，适合探索性研究。我们通常建议：发现阶段用质谱广筛，验证阶段用Olink精准确证，两者结合效率最高。

这取决于研究目的。如果是肿瘤微环境细胞图谱类研究，建议每组至少5-10例样本，每例捕获5000-10000个细胞；如果是关注特定稀有细胞亚群，建议增加细胞捕获量到15000-20000个/例，或做富集处理。我们的技术团队会根据你的具体研究设计给出精准建议。

可以的。FFPE样本虽然核酸有一定程度降解，但甲基化芯片、靶向测序、空间转录组等技术都有成熟的FFPE解决方案。特别是甲基化检测，FFPE样本的DNA甲基化修饰保存完好，检测质量和新鲜冰冻样本差异不大。我们有丰富的FFPE样本处理经验，样本质量评估后会给出最适合的技术方案建议。

典型的肿瘤早筛研究分三步走：1）发现阶段：用小规模样本（病例/对照各30-50例）进行高通量筛选（甲基化芯片/蛋白组），找到候选标志物；2）验证阶段：用独立大样本队列（几百到上千例）对候选标志物进行验证，构建诊断模型；3）临床评估：在真实世界队列中评估临床性能。我们可以提供从实验设计到数据分析的全程支持。

可以。我们有专业的技术团队，包括生信分析专家和项目方案经理，可以根据你的研究目标、样本类型、预算等条件，提供定制化的研究方案设计，包括技术路线选择、样本量估算、统计分析方法、预期结果等。方案设计服务是免费的，欢迎咨询。

标准交付包括：原始测序数据、质控报告、标准化分析报告（含图表）、差异分析结果、功能富集分析、可视化结果等。对于定制化分析需求，我们还可以提供高级分析内容，如WGCNA、预后模型构建、列线图、生存分析、多组学整合分析等。所有数据和报告都通过加密云盘交付，确保数据安全。

两者各有优势，经常联合使用。流式细胞术适合已知Marker的细胞定量，速度快、成本低、适合大样本量；单细胞测序可以无偏地发现新的细胞亚群和Marker，适合探索性研究。推荐策略：先用单细胞测序发现新的细胞亚群和Marker，再用流式在大队列中验证。我们也提供"单细胞发现 + 流式验证"的一站式服务。

空间转录组可以保留组织的空间位置信息，回答"不同区域的细胞在表达什么"这个单细胞测序无法回答的问题。在肿瘤研究中，它可以帮助我们了解：肿瘤边缘区和中心区的基因表达差异、免疫细胞在肿瘤组织中的空间分布、肿瘤细胞和基质细胞的空间相互作用等，对理解肿瘤微环境和免疫治疗机制非常有价值。

WGBS (covers all CpGs in the genome, most comprehensive but costly). For cancer research biomarker screening, we typically recommend array-based broad screening first, followed by targeted sequencing or WGBS for in-depth validation of candidate regions.">简单来说：样本量大、预算有限、关注已知CpG区域 → 选甲基化芯片（EPIC 935K，覆盖93.5万个CpG位点，性价比高，数据稳定）；样本量小、预算充足、想做全新发现 → 选WGBS（覆盖全基因组所有CpG，信息最全但成本高）。对于肿瘤研究，如果是biomarker筛选阶段，我们通常推荐先用芯片广筛，找到候选区域后再用靶向测序或WGBS深入验证。

有的。中科普瑞已协助客户在肿瘤研究领域发表数百篇SCI论文，涵盖肺癌、肝癌、结直肠癌、乳腺癌等多个癌种，合作期刊包括Nature Communications、Cancer Research、Clinical Cancer Research等顶刊。你可以在我们的合作案例页面查看详细文献列表，也可以咨询我们的技术顾问获取同领域研究参考方案。