衰老研究
多组学解决方案

常用的甲基化时钟包括：Horvath第一代时钟（泛组织适用，经典参考）、Hannum时钟（基于血液，年龄预测更准）、GrimAge（基于死亡风险，与健康和寿命最相关）、PhenoAge（基于生理表型，预测疾病风险）、DunedinPACE（基于衰老速率，评估年轻人群更灵敏）。选择建议：如果是评估整体生物学年龄，推荐 Horvath + GrimAge 组合；如果是评估干预效果，推荐 DunedinPACE（速率型更灵敏）；如果是疾病相关研究，推荐 PhenoAge 或 GrimAge。我们的 CpG时舟 工具支持7+种时钟模型一键计算。

WGBS whole-genome bisulfite sequencing offers more comprehensive coverage (all CpGs in the genome) and is suitable for discovering new clocks or conducting in-depth mechanistic studies, but at a higher cost. Regarding sample size: for cohort studies or intervention evaluations, we recommend at least 30 samples per group for statistical significance; for exploratory mechanistic studies, 10-15 samples can be a starting point. Our technical team will provide specific recommendations based on your research objectives.">芯片（EPIC 935K）是目前甲基化年龄检测的金标准方法，覆盖的CpG位点包含了所有主流时钟模型的位点，数据稳定、成本适中、适合大样本量；WGBS全基因组甲基化测序覆盖更全面（全基因组所有CpG），适合需要发现新时钟或做深度机制研究的场景，但成本更高。样本量方面，如果是队列研究或干预评估，建议每组至少30例样本才有统计学意义；如果是机制探索性研究，10-15例也可以起步。我们的技术团队会根据你的研究目的给出具体建议。

可以做甲基化年龄检测的样本类型包括：全血、外周血白细胞、血浆/血清cfDNA、唾液、口腔拭子、新鲜/冰冻组织、FFPE石蜡组织等。其中外周血是最常用、数据最稳定的样本类型。FFPE样本虽然DNA有一定降解，但甲基化修饰保存完好，可以用于甲基化芯片检测，只是需要调整DNA起始量和实验流程。我们有丰富的FFPE样本处理经验。

因为甲基化和蛋白组分别反映了衰老的不同维度：甲基化反映的是"表观遗传衰老"（细胞的累积损伤和调控变化），蛋白组反映的是"功能衰老"（实际蛋白质水平的变化和功能影响）。两者联合有三个优势：1）更精准的衰老评估——甲基化时钟告诉你"老不老"，蛋白组告诉你"为什么老"；2）机制解析更深入——甲基化差异可能驱动了蛋白表达变化，联合分析可以找到因果关系；3）发现新的biomarker——两个组学交叉验证，假阳性更低，结果更可靠。

典型的干预效果评估设计包括：1）自身前后对照：干预前、干预中（中期）、干预后分别采样，看甲基化年龄和蛋白组的动态变化；2）平行对照：干预组 vs 安慰剂组，干预结束后比较两组差异；3）剂量梯度：如果是药物或化合物，设置不同剂量组找量效关系。样本采集时间点很重要：干预前必采（基线），干预后至少采1次（评估效果），如果是长期干预建议每3-6个月采一次。我们可以提供免费的实验设计咨询。

CpG时舟是我们自主开发的甲基化年龄在线计算工具，支持7+种主流时钟模型，上传甲基化芯片数据后可以一键生成专业PDF报告。如果你已经有甲基化芯片数据，可以直接用CpG时舟免费计算（部分高级功能需要授权）；如果你还没有数据，可以找我们做甲基化芯片检测服务，检测完成后我们会附赠CpG时舟的完整分析报告，包括多时钟对比、年龄加速度、位点水平可视化等内容。

Olink for precise validation and large cohort studies. We typically recommend a combined strategy of 'mass spectrometry discovery + Olink validation'.">Olink蛋白组在衰老研究中有几个独特优势：1）灵敏度高（pg级），能检测到低丰度的细胞因子和信号分子，这些往往是衰老相关分泌表型（SASP）的关键因子；2）样本量小（仅需1μL血浆/血清），适合珍贵样本或大样本量队列；3）重复性好（CV<10%），纵向追踪干预效果更可靠。和质谱的关系是互补的：探索新的衰老蛋白用质谱广筛，验证和大队列研究用Olink精准确证。我们通常建议"质谱发现 + Olink验证"的组合策略。

可以的。单细胞转录组测序可以在单细胞分辨率下研究衰老相关的细胞异质性变化，比如：哪些细胞类型衰老最明显、衰老细胞的基因表达特征是什么、免疫细胞的衰老状态如何等。结合单细胞ATAC-seq还可以研究染色质可及性的衰老变化。单细胞衰老研究的独特价值在于：它能告诉我们"哪种细胞在衰老"和"为什么这种细胞会衰老"，而bulk测序只能看到平均值，掩盖了细胞间的差异。

代谢组学可以反映机体的代谢状态和功能水平，是衰老研究的重要维度。在衰老研究中，代谢组的主要应用包括：1）发现衰老相关的代谢标志物（如NAD+、氨基酸、脂质代谢变化）；2）解析抗衰老干预的代谢通路机制；3）评估代谢健康状况和衰老相关疾病风险；4）多组学联合分析中作为"功能表型"层面的验证。我们提供非靶向代谢组和靶向代谢组两种方案，可以根据研究需求选择。

标准交付包括：原始数据、质控报告、单组学分析报告（差异分析、富集分析、可视化图表等）、多组学联合分析报告（关联分析、整合网络、关键因子筛选等）。对于衰老研究的定制化分析，还可以提供：多时钟甲基化年龄计算报告、年龄加速度分析、衰老亚型分类、干预效果评估统计、机器学习预测模型构建等。所有数据通过加密云盘交付，确保数据安全。

Case Studies page, or consult our technical advisors for reference research plans and literature recommendations in your specific area.">有的。中科普瑞已协助客户在衰老研究领域发表多篇高质量论文，涵盖甲基化衰老时钟、衰老相关疾病、抗衰老干预机制等方向，合作期刊包括Nature Aging、Cell Metabolism、Age and Ageing等。你可以在我们的合作案例页面查看详细文献列表，也可以咨询我们的技术顾问获取同研究方向的参考方案和文献推荐。