华大智造官方认证 国产自主可控 高通量单细胞

DNBelab C4 高通量单细胞转录组测序

基于Drop-seq液滴捕获原理的国产自主可控高通量单细胞平台,搭载DNBSEQ-T7超高通量测序系统,一次检测上万细胞基因表达谱,高性价比降低单细胞研究门槛,从组织到数据的一站式服务。

360+
SCI合作文章
10,000+
单细胞/样本
1,000+
基因/细胞中位数
12min
3' RNA上机
官方认证

华大智造DNBelab C4系列认证服务商

中科普瑞 / 上海鲸舟基因 · 2024年8月官方认证

产品概述

国产高通量单细胞测序平台

DNBelab C4 高通量单细胞RNA文库制备系统基于Drop-seq液滴捕获原理,将带有Cell Barcode的凝胶微珠(大磁珠)、带有oligo测序标签的凝胶微珠(小磁珠)和单个细胞包裹在同一个油包水液滴中。细胞裂解后mRNA被大磁珠oligo-dT捕获,与小磁珠测序接头结合,在液滴中进行逆转录反应,破乳回收后构建cDNA文库和Oligo文库,最后上机测序。

平台搭载DNBSEQ-T7超高通量测序系统,支持3' RNA单细胞转录组测序,一次检测上万细胞基因表达谱,实现高灵敏度、高稳定性、高性价比的单细胞研究解决方案。

标准通量
5,000-10,000 单细胞/样本
灵活载片
支持1~4张载片独立运行
基因检测数
1,000+ 基因/细胞(中位数)
组学兼容
单细胞3' RNA及ATAC文库制备
应用方向

广泛覆盖生命科学研究领域

大规模细胞图谱构建

绘制组织器官水平的全细胞类型表达图谱

细胞亚群细化与稀有细胞鉴定

精细分群,鉴定低比例稀有细胞类型

肿瘤方向研究

肿瘤微环境、异质性、耐药机制研究

干细胞发育与分化研究

追踪细胞分化轨迹与发育调控网络

免疫方向研究

免疫细胞分型、免疫应答机制解析

生物标志物与疾病分型

疾病分子分型、诊断与预后标志物筛选

技术原理

Drop-seq 液滴捕获技术原理

基于微流控技术,将单细胞、大磁珠(Cell Barcode)和小磁珠(测序标签)共同包裹于油包水液滴中,在液滴内完成细胞裂解、mRNA捕获和逆转录。

① 单细胞+磁珠 细胞+大磁珠+小磁珠 ② 液滴包裹 Oil 油包水微滴生成 ③ 细胞裂解&捕获 mRNA被磁珠捕获 ④ 逆转录 液滴内cDNA合成 ⑤ 建库&测序 DNBSEQ DNBSEQ-T7测序
实验流程

5步标准实验流程

从样本质检到测序交付,完整标准化的单细胞测序实验流程。

1

细胞悬液质检

活性>80%,浓度700~1200 cells/μL为佳

2

GEM生成

液滴包裹单细胞与磁珠

3

GEM-RT & cDNA扩增

逆转录+破油纯化+扩增质检

4

文库构建&质检

片段化+Index PCR+质检

5

NGS高通量测序

DNBSEQ-T7,PE150,推荐50K reads/cell

技术优势

5大核心技术优势

从捕获效率到数据分析,全流程保障单细胞测序数据质量。

1.3%

稀有细胞高效捕获

99:1混合细胞中可检出1.3%稀有细胞比例,灵敏度出众

多类型

多种样本兼容

兼容活细胞悬液+液氮速冻样本(细胞核水平研究),不限物种

高保真

测序数据高保真

搭配DNBSEQ测序系统,单个细胞数据不混淆,准确性高

Dr.Tom

自主交互分析

Dr. Tom单细胞全交互式数据挖掘系统,深度数据挖掘

一站式

一站式服务

支持流式分选服务,从组织到数据的全流程解决方案

5,000~10,000
标准通量(单细胞/样本)
1,000+
每细胞检测基因数(中位数)
12,822
液氮速冻肺组织细胞核数
360+
合作SCI文章发表
生信分析

全面的单细胞生物信息分析

从基础定量到高级分析,提供完整的单细胞数据解读方案。

标准分析流程

1

单细胞基因定量

质控、比对、定量→表达谱矩阵

2

细胞亚群聚类

降维、聚类、细胞类型判定

3

差异&标志基因分析

热图、小提琴图、特征图

4

功能富集分析

GO、KEGG、GSEA富集分析

拟时序分析

重构细胞分化轨迹,解析发育进程中的基因动态表达调控。

细胞通讯分析

基于配体-受体对的细胞间相互作用预测,揭示微环境细胞通讯网络。

免疫组库分析

TCR/BCR V(D)J重组分析,克隆型多样性评估,免疫组库特征解析。

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样本要求

送样要求指南

样本类型 送样量 说明
组织样本 100-200mg 黄豆粒大小,湿重
细胞样本 >105 cells 活细胞悬液
全血样本 4mL EDTA采血管

上机标准

  • 细胞总数:> 1~2 × 105
  • 细胞浓度:> 200 个/μL
  • 细胞活性:> 80%
  • 细胞直径:< 40μm
  • 无结团、无明显杂质
服务方案

灵活的服务方案选择

基础版

单细胞转录组测序基础服务

包含细胞悬液质检、GEM生成、文库构建、测序及标准分析

标准分析 50K reads/cell 表达矩阵交付
推荐

单细胞转录组测序高级服务

基础服务全部内容 + 高级分析(拟时序/细胞通讯/富集分析等)+ Dr.Tom系统

高级分析 Dr.Tom交互系统 定制化分析
旗舰版

多组学联合分析全流程

单细胞转录组 + 蛋白组/空间转录组/ATAC等多组学联合 + 完整方案设计

多组学联合 方案设计 项目全程跟进
* 具体服务周期视项目而定,欢迎咨询获取定制方案
常见问题

您可能想了解的问题

Q1: DNBelab C4平台与其他单细胞平台相比有什么优势?

DNBelab C4平台基于Drop-seq液滴捕获原理,是国产自主可控的高通量单细胞平台,搭载DNBSEQ-T7超高通量测序系统。其主要优势包括:高性价比,显著降低单细胞研究门槛;稀有细胞捕获效率高,99:1混合细胞中可检出1.3%稀有细胞;兼容活细胞悬液和液氮速冻样本;搭配DNBSEQ测序系统数据保真度高;并配备Dr. Tom交互式分析系统,一站式服务流程。

Q2: 一个样本可以检测多少个细胞?测序数据量怎么选?

标准通量为5,000-10,000个单细胞/样本,实际捕获细胞数会因样本类型和质量有所差异。推荐测序深度为50K reads/cell,可根据研究目的调整:细胞图谱类研究建议更高深度,细胞分群类研究50K reads/cell通常可满足需求。具体方案可咨询技术支持进行评估。

Q3: 冻存组织样本可以做单细胞测序吗?

可以。DNBelab C4平台兼容液氮速冻样本,可通过提取细胞核进行单核RNA测序(snRNA-seq),适用于难以制备活细胞悬液的样本,如临床冻存组织、珍贵样本等。液氮速冻肺组织样本可获得约12,822个细胞核,每细胞核检测基因数中位数可达1,000以上。

Q4: 可以进行哪些物种的单细胞测序?有物种限制吗?

DNBelab C4平台不限物种,只要有参考基因组或转录组序列即可进行分析。目前已成功应用于人、小鼠、大鼠、斑马鱼、拟南芥等多种动植物物种。对于非模式物种,需要根据可用的基因组/转录组注释信息进行评估。

Q5: 单细胞测序服务的交付内容有哪些?

标准交付内容包括:原始测序数据(fastq格式)、基因表达矩阵、质控报告、标准分析结果(降维聚类、差异分析、细胞类型注释、富集分析等)及可视化图表。高级服务额外交付高级分析结果(拟时序、细胞通讯等)。所有服务均提供Dr. Tom交互式数据分析系统账号,可自主进行深度数据挖掘。

Q6: 单个样本的细胞活性低于80%怎么办?

细胞活性低于80%的样本,我们会先进行质检评估。可以考虑使用死细胞去除试剂盒进行富集,或改用单核测序方案。建议提前与技术人员沟通样本情况,我们会根据具体样本类型和状态给出优化的实验方案建议。

Q7: 可以同时处理多少个样本?需要分批吗?

DNBelab C4平台支持1~4张载片独立运行,每张载片可处理多个样本通道,具体数量视实验方案而定。平台灵活度高,可根据项目样本量安排实验批次,无需凑样等待。如有大批量样本,可咨询技术支持制定合适的批量实验方案。

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