转录组测序是对特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整mRNA进行测序的技术,通过oligo d(T)富集方法结合高通量测序研究mRNA的表达和调控。通过与参考基因组比对,可获得基因结构、基因表达差异和可变剪接等信息,揭示特定生物学过程中的分子机理,已广泛应用于基础研究、临床诊断、药物研发和分子育种等领域。
从样本抽提到生信分析,十步标准流程确保数据质量与分析可靠性
样本总RNA抽提
浓度与完整性检测
oligo d(T)富集
纯化mRNA
mRNA片段化
反转录合成cDNA
末端修复
3'端加A尾
测序接头连接
链特异可选
PCR扩增
文库富集
浓度检测
片段大小分析
主流测序平台
PE 150测序
原始数据过滤
质量评估
表达定量
差异与富集分析
丰富的样本处理经验与多样化建库能力,为您的研究提供可靠保障
易降解样本、微量样本均有专门的抽提解决方案,确保样本质量满足建库要求
兼容FFPE、血浆、外泌体等多种特殊样本类型,普通与链特异文库均可选
标准分析+高级分析+定制化分析三级体系,满足不同深度的研究需求
普通测序与链特异测序可选,数据量按需定制,匹配不同研究目的与预算
实验周期短、质量可靠,专业技术团队全程跟进,确保项目顺利完成
dUTP法链特异性文库保留转录本方向信息,反义转录本鉴定更准确
根据研究目的选择合适的测序方案,满足不同层次的分析需求
| 参数项 | 推荐规格 | 说明 |
|---|---|---|
| 测序模式 | PE 150 | 双端150bp测序,兼顾读长与通量,适合常规转录组分析 |
| 推荐数据量 | 5-8 G / 样本(常规表达分析) | 常规基因表达分析推荐5-8G;如需可变剪接或新转录本分析可适当增加数据量 |
| 数据质量 | Q30 ≥ 85% | 碱基识别准确率Q30达85%以上,保障后续分析的可靠性 |
| 文库类型 | 普通mRNA文库 / 链特异文库(dUTP法) | 链特异文库可保留转录本的方向信息,提高反义转录本和基因结构分析的准确性 |
| 样本类型 | 组织、细胞、FFPE、血浆、外泌体等 | 多种样本类型均有成熟处理方案,具体请咨询技术顾问 |
| 项目周期 | 视项目而定 | 受样本数量、样本类型、分析内容等因素影响,具体周期请咨询技术顾问 |
标准分析+高级分析+定制化分析,从基础到深入满足不同研究目标
基础转录组分析必备内容
碱基质量分布、GC含量分布、接头序列去除
reads比对率统计、基因区域分布统计
FPKM / TPM / Counts 三种定量方式
样本间相关性热图、主成分分析
DESeq2 / edgeR 算法,差异基因筛选与火山图
差异基因的功能注释与通路富集分析
深入挖掘转录组数据价值
五种可变剪接事件鉴定与差异分析
融合基因检测与注释,肿瘤研究重要方向
新转录本组装、编码能力预测与注释
基因集富集分析,发现整体表达趋势变化
WGCNA加权基因共表达网络分析
时间梯度样本的表达趋势聚类与动态分析
* 除标准分析和高级分析外,我们还提供定制化分析服务,根据您的研究需求制定专属分析方案
多种样本类型均有成熟处理方案,专业技术团队全程指导样本准备
| 样本类型 | 推荐起始量 | 保存与运输 | 注意事项 |
|---|---|---|---|
| 组织样本 | 绿豆粒大小(约50-100mg) | RNAlater或Trizol保存,-80℃储存,干冰运输 | 取样后立即投入RNAlater或Trizol中,避免反复冻融;FFPE样本需确认RNA完整性 |
| 细胞样本 | 1 × 106 个细胞 | Trizol裂解保存,-80℃储存,干冰运输 | 收集细胞后立即加入Trizol裂解,充分混匀;避免细胞过度生长导致RNA降解 |
| 全血样本 | 2.5ml(PAXgene管)或3ml(EDTA管) | PAXgene管常温/冷藏;EDTA管需尽快处理,干冰运输 | 使用PAXgene管可稳定保存RNA;EDTA抗凝管取样后需尽快分离白细胞或抽提RNA |
| 血清/血浆 | 1 ml | -80℃保存,干冰运输 | 避免溶血;血浆样本注意抗凝剂选择;建议分离后立即分装冻存 |
| 其他类型 | 尿液、外泌体等可沟通 | 视样本类型而定 | 特殊样本类型请提前咨询技术顾问,我们将提供针对性的样本处理方案 |
基础版、高级版、定制化服务,灵活匹配不同研究需求与预算
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