Small RNA(小RNA)是指长度在18~30nt的内源性RNA,包括miRNA、siRNA、piRNA等,在mRNA的转录及转录后水平调控中发挥重要作用,参与细胞生长、分化、代谢等生物学过程。Small RNA测序基于高通量测序平台对目标样本的小RNA进行大规模检测,同时发现新的小RNA,结合生物信息学挖掘其功能、结构和调控机制。miRNA是小RNA中最主要的部分,广泛应用于疾病诊断、个性化治疗和预后等领域。
基于QIAseq miRNA建库方案,UMI分子条形码技术实现精准无偏倚定量
总RNA提取
保留小RNA组分
PAGE胶回收
18-30nt片段
3'/5'接头连接
反转录含UMI
文库质检
高通量测序
鉴定定量
靶基因分析
丰富项目经验与专业技术团队,保障实验质量与分析深度
针对易降解、微量样本有专门解决方案,保障小RNA提取质量
兼容FFPE、血浆、外泌体等特殊样本,适应不同研究场景
精准无偏倚定量,减少PCR扩增偏差,真实反映样本表达水平
标准+高级+定制三级分析体系,满足不同深度研究需求
协助客户发表多篇相关文章,提供从实验设计到论文支持的全程服务
专业技术团队提供一对一咨询,从方案设计到结果解读全程保障
标准测序策略,保障数据质量与分析深度
| 参数项目 | 说明 |
|---|---|
| 测序模式 | SE 50(单端50bp) |
| 推荐数据量 | ≥ 20 M clean reads /样本 |
| 数据质量标准 | Q30 ≥ 85% |
| 建库方案 | QIAseq miRNA建库方案(含UMI分子条形码) |
| 检测范围 | miRNA、siRNA、piRNA、tRNA、snoRNA、snRNA等18~30nt小RNA |
| 项目周期 | 视项目而定 |
从数据质控到调控网络构建,提供系统化生物信息分析
原始数据质控、接头去除、低质量reads过滤
miRNA / piRNA / siRNA / tRNA / snoRNA / snRNA 分类注释
已知miRNA鉴定与定量分析 + 新miRNA预测
样本间miRNA表达相关性分析与PCA分析
组间差异miRNA筛选、火山图、聚类热图
TargetScan / miRanda 靶基因预测分析
靶基因 GO / KEGG 富集分析
多种样本类型兼容,专业样本处理保障实验质量
| 样本类型 | 送样要求 | 保存与运输 |
|---|---|---|
| 组织样本 | 绿豆粒大小(约50-100mg),RNAlater或Trizol保存 | 液氮速冻后-80℃保存,干冰运输 |
| 细胞样本 | 1×10^6个细胞,Trizol裂解保存 | -80℃保存,干冰运输 |
| 全血样本 | 2.5ml(PAXgene管)或3ml(EDTA管) | PAXgene管可常温运输;EDTA管需尽快分离 |
| 血清/血浆 | 1ml血清或血浆 | -80℃保存,干冰运输,避免反复冻融 |
| 其他类型 | 尿液、外泌体等其他样本类型可沟通咨询 | 根据样本类型选择合适的保存运输方式 |
注意事项
小RNA样本需使用保留小RNA的专用提取方法,避免在常规RNA提取过程中丢失小RNA组分。如对样本质量有疑问,建议先进行样本质检评估。
基础/高级/定制三级方案,满足不同研究深度需求
标准小RNA测序与基础分析,适合初步探索研究
包含基础方案全部内容 + 高级分析模块,深入挖掘调控机制
根据研究方向和需求,量身定制实验设计与分析方案
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