单细胞测序 全转录组 3' mRNA 捕获 低多细胞率

BD Rhapsody™ 单细胞全转录组测序(WTA)
高通量单细胞全转录组表达谱分析

基于BD Rhapsody™微孔阵列+寡核苷酸标记磁珠技术,将单个细胞物理分隔于微孔中,通过磁珠上的Cell Barcode+UMI+poly-dT探针捕获并标记单个细胞释放的mRNA,实现单细胞分辨率的全转录组表达谱分析。单次实验可捕获100~20,000个单细胞。

BD Rhapsody™ Single Cell
Cell Barcode + UMI
微孔+磁珠双捕获
核心优势

为什么选择 BD Rhapsody™ 平台

微孔物理分隔技术带来低多细胞率、高捕获效率和稳定的数据质量

高捕获效率

有效细胞捕获率较高,细胞回收率表现稳定

低多细胞率

微孔物理分隔技术,多细胞率 < 1%

实时质量监控

实验过程可实时监测样本状态

中性粒细胞友好

对易降解的中性粒细胞等样本兼容性较好

灵活可扩展

支持多样本标记(SMK)、蛋白组(AbSeq)、靶向panel等模块叠加

技术流程

标准实验流程,稳定可靠的数据产出

从样本制备到生信分析,全流程标准化质控,确保实验结果的稳定性与可重复性

1

样本制备

组织解离/细胞收集,制备单细胞悬液

2

细胞悬液质检

细胞计数、活率检测、直径测量

3

单细胞捕获

细胞悬液上样,微孔+磁珠捕获单个细胞mRNA

4

逆转录与扩增

RT合成cDNA,RPE随机引物扩增

5

文库构建

片段化、Index PCR、文库质检

6

高通量测序

PE150测序

样本要求

样本准备指南

规范的样本制备是高质量单细胞数据的基础,请在送样前参考以下要求

项目 要求
样本类型 新鲜组织、细胞悬液、全血(需分离PBMC)等
组织量 约黄豆粒大小(湿重100~200 mg)
细胞总量 ≥ 1×10⁵ 个活细胞(建议1~2×10⁵,可分装备份)
细胞浓度 ≥ 200 个/μL(建议300~800 cells/μL)
细胞活率 ≥ 80%
细胞直径 ≤ 40 μm
其他要求 无细胞结团,无明显杂质
生信分析内容

全面的生信分析方案

从标准分析到高级分析,提供多维度的单细胞数据挖掘与可视化服务

标准分析

原始数据质控与细胞/基因过滤
基因表达定量与表达矩阵构建
PCA降维、UMAP/t-SNE可视化
无监督聚类与细胞亚群鉴定
差异基因分析与Marker基因筛选
细胞类型注释(基于参考数据库)
GO/KEGG功能富集分析

高级分析(可选)

细胞拟时序分析(Trajectory inference)
细胞通讯分析(CellPhoneDB / NicheNet)
基因调控网络分析
GSEA基因集富集分析
细胞周期评分、线粒体含量评估
多样本整合与批次校正
应用场景

广泛的研究应用方向

适用于生命科学研究的多个领域,助力高水平科研成果产出

细胞图谱构建

大规模细胞图谱绘制与细胞类型普查

细胞亚群细化

稀有细胞类型鉴定与细胞亚群细分

肿瘤异质性研究

肿瘤微环境与耐药机制解析

干细胞发育

干细胞分化与发育轨迹研究

免疫细胞分群

免疫细胞亚群鉴定与功能研究

发育生物学

胚胎发育与组织器官发生研究

疾病分型

疾病分子分型与生物标志物发现

多组学扩展

可与蛋白组、免疫组库等多组学联合

推荐测序量

≥ 50,000 reads/cell

高通量测序平台,PE150

获取方案
研究案例

WTA 技术助力发表高水平研究

基于 BD Rhapsody WTA 全转录组测序的代表性研究成果

JOURNAL OF EXPERIMENTAL & CLINICAL CANCER RESEARCH IF 14.3

S100A9+CD14+单核细胞通过削弱T细胞介导的抗肿瘤功能促进晚期肝细胞癌抗PD-1免疫治疗耐药

合作单位:浙江大学第一附属医院

本研究探讨S100A9+CD14+单核细胞在晚期肝细胞癌(HCC)抗PD-1单药治疗耐药中的作用。通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,发现此类单核细胞可通过削弱T细胞介导的抗肿瘤功能促进耐药。研究为HCC免疫治疗耐药机制提供新见...

常见问题

FAQ 常见问题解答

关于产品和实验的常见问题,更多问题请联系技术支持

Q WTA 和靶向转录组(TTA)有什么区别?
A

WTA 检测全基因组范围的 mRNA 表达,适合探索性研究和细胞图谱构建;TTA 针对指定基因 panel 进行高深度靶向检测,灵敏度更高、成本更低,适合已知目标基因的验证和大规模样本筛查。

Q 细胞活率低于 80% 可以做吗?
A

建议活率 ≥ 80% 以保证数据质量。活率在 70%~80% 之间的样本需提前沟通评估,低于 70% 可能影响捕获效率和数据质量。

Q 一次可以捕获多少细胞?
A

BD Rhapsody 单次实验可捕获 100~20,000 个细胞/通道,具体根据实验设计和样本情况调整。

05 BD WTA和10x转录组测序哪个更好?
BD WTA和10x Genomics各有特点:BD WTA采用微孔技术,细胞捕获效率高、双细胞率低,可检测更多的基因数目,适合大队列样本和需要高检测灵敏度的研究;10x Genomics是市场主流平台,文献更多、生态更成熟。具体选择应根据研究目的、样本类型和预算综合考虑。中科普瑞同时提供两大平台服务,可根据研究需求推荐最合适的方案。
06 BD WTA单细胞转录组的样本要求是什么?
BD WTA要求细胞活性不低于70%,细胞总量建议不少于5×10^5个,细胞浓度在500至1000 cells/μL之间。支持PBMC、细胞系、新鲜组织解离细胞、冻存细胞等多种样本类型。不同样本类型的处理方案略有差异,送样前建议与技术团队确认具体样本准备方案。
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